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Unity5.3.1f1で5.2系のプロジェクトファイルを開く途中でUnityが固まってしまった。
それ以降、そのファイルを開こうとすると、下記のメッセージが表示され、プロジェクトを開くとUnityがクラッシュするようになった。
“The file ‘MemoryStream’ is corrupted! Remove it and launch unity again!
[Position out of bounds!]

ググっても具体的な解決方法がわからず途方にくれてたら神から救いの手が。
LibraryフォルダとTempフォルダを削除後、エディタを再起動で直るとのこと。
(LibraryとTempは自動生成なので消しても大丈夫とのこと)
実際に試してみたら解決できました!!
@fum1h1roさんありがとうございました!!